Az Endzone 2-ben az emberiség a kihalás szélén áll egy katasztrófát követően, hogy egy szebb jövő jöjjön el, fel kell fedeznünk a lepusztult világot, hogy új településeket alapítsunk, építkezzünk. Ezeket új épületekkel és technológiákkal fejleszthetjük, bővíthetjük, ahogy találunk erőforrásokat hozzá.
Az első Endzone folytatásaként a második játékban járműveket találhatunk, javították az NPC-k viselkedését, a térképet külön zónákra bontották, megváltoztatták az expedíciós rendszert és javították a látványt. Több települést is létrehozhatunk, de a mérgező eső, a szárazság és a radioaktivitás továbbra is állandó fenyegetést jelent a terjeszkedésre.