A játék főhőse, Olimar Kapitány, aki a Hocotate bolygó szülötte. Egy napon intergalaktikus kirándulásra adja kerek fejét, nekivág az utazásnak, ám váratlanul egy üstökös csapódik a S.S. Doplhin névre keresztelt űrhajójába, majd azt egy ismeretlen bolygó vonzástere szippantja magához. Landoláskor darabokra hullik az S.S. Dolphin, nélküle pedig Olimar kapitány a feltérképezetlen égitest foglya marad.
Ismét útra kelünk, hogy életet leheljünk a károsodott űrhajónkba, az alkatrészek gyűjtögetése közben viszont furcsa lényekbe botlunk, úton-útfélen, akik cseppet sem könnyítik meg a küldetést. Jól hangzik? Kihagytad a Game Cube-os verziót? Akkor gördülj lejjebb, nézzél körül és dönts belátásod szerint. Ha szíven ragadott Miyamoto mester varázslata, február hatodikától a Tiéd lehet.