Az MSI X99A GAMING PRO CARBON szintén a legfelsőbb szegmensbe tartozó Intel processzorokhoz érkezik, hiszen X99-es chipkészletre épül, így az LGA 2011-3 foglalatú processzorokat támogatja. Az USB 3.1 Type-A és Type-C csatlakozások és a karbonnal díszített külső mellett a Mystic Light RGB LED-ek emelendőek ki, melyek egyedi hangulatot teremtenek a házak belsejében.