A Rebellion blogján megjelent nyílt levél tanulsága szerint a stúdió mindig is kereste annak a lehetőségét, hogy egy teljes értékű folytatással kedveskedjen a PC-re megjelent első rész rajongóinak. Amikor a cégnél korábban potenciális folytatásról beszéltek, nem az Evil Genius Online-ra gondoltak, hiszen az akkor még javában fejlesztés alatt állt.
Bővebb tájékoztatást a közeljövőben ígér a Rebellion csapata. Az eredeti játék még 2004-ben jelent meg az akkori Elixir Studios műhelyében, ők azonban nem sokkal később lehúzták a rolót, a folytatás elkészítésének jogait pedig a Rebellion szerezte meg.