De van más is: ha bármilyen illegális tevékenységet követünk el (polgárokat ölünk meg, vagy meghatározott térképhelyszíneken kívülre megyünk), akkor az animusból is deszinkronizálódunk és rögtön az elejére kerülünk. A permadeath módot új játék indításakor engedélyezhetjük, de mentés közepén nem engedélyezhető, illetve nem kapcsolható ki.