A mash-up tizenhat klasszikust tartalmaz: Balloon Fight, Donkey Kong, Donkey Kong Jr., Dr. Mario, Excitebike, Kid Icarus, Kirbys Adventure, Mario Bros., Metroid, Punch-Out!!, Super Mario Bros., Super Mario Bros. 2, Super Mario Bros. 3, Super Mario Bros.: The Lost Levels, The Legend of Zelda, és Zelda II The Adventure of Link.

Rengeteg olyan új kihívás várat magára, mint a versengő Championship mód, egy nagy sebességű Super Mario Bros. változat és a lehetőség, hogy Princess Peach saját magát mentse meg. A kihívások pontszámai összehasonlításra és helyi ranglistákra kerülnek, amik tartalmazni fogják a sikeres kihívások videóit.

Ha előrendeled a 3DS Ultimate NES Remix-et a Nintendo hivatalos boltjából, akkor ingyen kapsz egy NES-témájú baseball sapkát is.