A platformerről tudni kell, hogy első ízben nem kevesebb, mint 7 (!) esztendővel ezelőtt látott napvilágot, méghozzá PC-re, visszafogott sikerei ellenére pedig később megjelent WiiWare és DSiWare rendszerekre is, amelyek közül utóbbi verzió nem volt elérhető Európában. A Cave Story 3D ugyanazt az alkotást dolgozza fel, csak éppen a Nintendo 3DS szájízére szabva.