Ezeket a japán közösség vetette fel a Shadows-szal kapcsolatban, állítja az ügyet ismerő, meg nem nevezett forrás. Ennek részeként a fejlesztők állítólag azt tervezik, hogy megváltoztatják Yasuke, – a vitatott fekete szamuráj, – történetének egyes részeit és azt, ahogyan őt a játékban ábrázolják.

Továbbá a játék bizonyos építészeti részleteinek és a történelmi környezet általános ábrázolásának felülvizsgálata is szerepel a stúdió tervei között. A hírek szerint a Ubisoft a szokásosnál később vonta be a történelmi szakértőket és tanácsadókat a fejlesztésbe, tekintettel a projekt ambiciózus terjedelmére.