Történt azonban, hogy nemes egyszerűséggel ellehetetlenítették a Steamen való vásárlást a kiadó kérésére, és mint kiderült, nem is kerül már vissza, lévén az indok a játékban lévő zenék joglicenceinek lejártában keresendő. Az Alpha Protocol kiadója, a Sega a Eurogameren keresztül közölte ezt, és úgy határoztak, a lassan 10 éves játékhoz nem újítják meg inkább a jogokat.
Öröm az ürömben, hogy aki megvásárolta korábban a játékot, az továbbra is hozzáférhet, szimplán újonnan nem lehet már megvásárolni.